基礎控除の改正は令和7年分の所得税から適用されることとなり、具体的には、下記のように所得金額に応じた段階的な控除が行われます。

基礎控除額（改正前）：48万円
基礎控除額（改正後）：58万円
加算額：37万円
加算後の基礎控除額：95万円

基礎控除額（改正前）：48万円
基礎控除額（改正後）：58万円
加算額：30万円
加算後の基礎控除額：88万円

基礎控除額（改正前）：48万円
基礎控除額（改正後）：58万円
加算額：10万円
加算後の基礎控除額：68万円

基礎控除額（改正前）：48万円
基礎控除額（改正後）：58万円
加算額：5万円
加算後の基礎控除額：63万円

なお、（1）については恒久的な措置ですが、（2）～（4）については、令和7～8年分の所得税のみに適用されます。
また、住民税については、上記のような基礎控除額の改正は行われないため、混同しないように注意が必要です。

先述した基礎控除の特例については、令和7年分の所得税では、毎月の給与計算には反映せず、12月1日以後に行う年末調整で適用します。

また、令和8年分以降についても、基礎控除額のベースアップ（48万円→58万円）に関しては給与計算時の「源泉徴収税額表」へ反映される一方で、「基礎控除の特例」による加算額については、「源泉徴収税額表」には反映されず、年末調整で対応することとなります。

そのため、「基礎控除の特例」の対象となる従業員については、年末調整時の還付額が増える可能性も高まります。
したがって、そのような従業員が数多く在籍する企業では、年末調整還付額の拡大によるキャッシュフローへの
影響についても慎重に考慮しましょう。

所得税における基礎控除が大幅に改正され、所得金額に応じた段階的な控除が導入されます。

令和7年分の所得税だけでなく、令和8年分以降も年末調整時で対応する必要があるため、企業側は還付額増加による支出額拡大も考慮することが重要です。